מי שפיקד על בסיס רעים בשבעה באוקטובר, ותחת פיקודו חדרו לבסיס מחבלים, הוא זה שיתחקר את מחדלי השבעה באוקטובר. זאת, בהתאם למדיניות בצה"ל לפיה מי שאחראי לפקד על הגזרה – הוא זה שיתחקר. כך פרסם עמית סגל בערוץ 12.

המפקד שיתחקר את אירוע החדירה לבסיס הוא סגן מפקד האוגדה. הוא היה זה שפיקד על תרגיל שנערך בבסיס בשלושה באוקטובר, ארבעה ימים לפני מתקפת הפתע. אותו תרגיל נכשל והאוגדה ספגה חדירות. עם זאת, הצבא החליט למנות את סגן המפקד לתחקר את אירועי השבת השחורה.

מדובר צה"ל נמסר: "התרגיל לא דימה תרחיש מתקפת פתע על בסיס רעים ומדובר בביקורת שגרתית שבחנה את נוהלי האבטחה במחנה ונהליה יושמו".