סאגת בחירת המנכ"ל לרבנות הראשית עדיין נמשכת.

בסוף שנת 2013 הסתיימה כהונתו בת שתי הקדנציות וחצי של מנכ"ל הרבנות הקודם, עודד וינר, אך בשל חוסר הסכמה בין המשרד לשירותי דת לבין הרבנים הראשיים לגבי איוש ועדת האיתור שתבחר את המנכ"ל החדש, ועל רקע ביקור האפיפיור בארץ, הוארכה כהונתו באופן חריג בחמישה חודשים נוספים.

למרות שעברו כבר קרוב לשנתיים, עדיין אין לרבנות הראשית מנכ"ל. בכנסת הקודמת לא מונה מנכ"ל בגלל כיפופי ידיים בין המשרד לשירותי דת והרבנות הראשית לישראל. כזכור אז היה המשרד בידי הבית היהודי ואפילו עלה שמו של מנכ"ל בית הלל הרב רונן נויברט כמועמד לתפקיד, אך הרבנים הטילו וטו על כל המהלך ותקעו את ועדת האיתור כשעל איושה ניטש ויכוח מר בין הרבנות והמשרד לשירותי דת. מי שמילא את מקום המנכ"ל הוא מנכ"ל המשרד לשירותי דת, שכבר קרוב לשנה מכהן בשני הכובעים במקביל.

כעת, לאחר הבחירות והעברת השליטה במשרד לידיים חרדיות, הוסר הוטו של הרבנים, והם קיבלו את מה שהוסכם כבר לפני יותר משנה וחצי.

על פי הנהלים של שירות המדינה, על הוועדה להיות מורכבת ממנכ"ל המשרד לשירותי דת כיום עו"ד עודד פלוס, נציב שירות המדינה משה דיין או נציג מטעמו, נציג ציבור שיימנה הרב הראשי לישראל הרב דוד לאו, נציג ציבור שיימנה מנכ"ל המשרד לשירותי דת בהתייעצות עם הרב הראשי ונציג ציבור שיימנה נציב שירות המדינה בהתייעצות עם המנכ"ל והרבנים הראשיים ביחד.

על התפקיד מתמודדים למעלה מ-120 שהגישו את מועמדותם למשרת מנכ"ל הרבנות הראשית. בעבר פרסנו שמות של מועמדים מובילים: עו"ד תומר מוסקוביץ', משמש כיום כמנכ"ל רשת הבנייה 'משהב' של הפועל המזרחי. בעבר שימש כיועץ המשפטי של משרד העבודה והרווחה בתקופת השר שלמה בניזירי וכיועץ המשפט של משרד התעשייה והמסחר בזמן אהוד אולמרט. לאחר מכן בזמן ההתנתקות מונה למשנה למנכ"ל מועצת סלע, והיה סגנו של יונתן בשיא, ובתפקידו שימש כיו"ר הוועדה לפיצויים מיוחדים עבור המגורשים.

המועמד השני הוא ד"ר דורון דנינו, מרצה  באוניברסיטת בר אילן החוקר את מקומה של הזהות הספרדית במדינת ישראל. דנינו חבר בארגון רבני צהר וחבר בבית היהודי כנציג הקיבוץ הדתי. בפריימריז האחרונים התמודד לרשימת המפלגה לכנסת ולא הצליח להכנס למקום ריאלי, הוא הוצב ברשימה לכנסת במקום ה-20 . לאחר הבחירות מונה לראש מטה השר לשירותי דת, אך לאחר תקופה קצרה הוחלף בתפקידו ומונה לדרגת יועץ לשר.

המועמד השלישי הוא אל"מ במיל' יונתן ברנסקי, שהשתחרר לאחרונה בצה"ל לאחר שירות ארוך בו כיהן כמפקד גדוד הנח"ל החרדי 'נצח יהודה', כראש מטה הרבנות הצבאית במקביל להיותו מפקד חטיבת מילואים אותה הוביל במבצע 'עופרת יצוקה, לאחר מכן שימש כסגן מפקד אוגדת עזה וכמפקד מגמת יבשה בפו"ם.

גם שמו של מנכ"ל נאמני תורה ועבודה שמואל שטח עלה והוא הגיש את מועמדותו.