לאחר שבית הדין לצד של האיחוד האירופי החליט לדחות את העתירות נגד ההחלטה של מחוזות ולוניה ופלנדריה בבלגיה לאסור על שחיטה כשרה, בישראל זעמו על השארת האיסור על כנו. שרת התפוצות עומר ינקלביץ' הבהירה הערב (חמישי) כי הדבר פוגע בחייהם של הקהילות היהודיות בבלגיה ובאירופה, שייאלצו לייבא בשר כשר ממקומות אחרים כתוצאה.

"הצטערתי והופתעתי מאוד לשמוע על החלטתו המקוממת של בית הדין האירופי לצדק לאפשר למדינות האיחוד לאסור שחיטה כשרה. ההחלטה מעמידה יהודים ומוסלמים בפני שוקת שבורה, ופוגמת במרקם החיים שלהם באירופה" אמרה ינקלביץ'. "כעת הצוותים המקצועיים במשרדי בוחנים ולומדים לעומק את ההחלטה. נפעל בהקדם, יחד עם בעלות בריתנו באירופה ובמוסדות האיחוד, במטרה להמשיך לאפשר קיום חיים יהודיים באירופה".

גם  שגריר ישראל בבלגיה עמנואל נחשון אמר כי "מדובר בהחלטה קטסטרופלית ומכה לחיים היהודים באירופה. כנראה שסובלנות ופלורליזם הם מילים ריקות בעיני חלק".

ראש הוועידה של רבני אירופה, הרב פנחס גולדשמידט, תקף גם כן את המהלך ואמר שכי "זו חוצפה שהם יקבעו לנו כיצד מתבצעת שחיטה כשרה על פי ההלכה היהודית, החלטה זו מרחיקה לכת מהצפוי והינה סטירה מצלצלת לנוכח ההצהרות האחרונות של המוסדות האירופיים כי יש לכבד את החיים היהודיים ולהילחם למען חופש הדת".