חמישה חודשים לאחר הטבח שביצע חמאס בעוטף עזה, ראש השב"כ רונן בר הורה (חמישי) להתחיל בחקירים מבצעיים באגפי הארגון, כך פרסם יוסי יהושע בווינט. על פי הדיווח, ההערכה היא שהתחקיר יימשך מספר שבועות ואף חודשים. בשב"כ אישרו את הפרטים. כמו כן, מבקר המדינה מתניהו אנגלמן החל בעבודת איסוף חומרים משירות הביטחון הכללי לצורך הבדיקה שהוא מקיים.

בארגון יערכו תחקיר על אותו לילה בין ה-6 ל-7 באוקטובר לאחר שהתקבלה באגפי הארגון ההתרעה לאפשרות פעולה מצד חמאס, את סוגיית כרטיסי הסים ועל כך שלא היה שום מידע מודיעיני משום סוכן בתוך החמאס שיעביר מידע על התכנון של ארגון הטרור לבצע את הטבח.