עצרת התפילה המרכזית בישיבת 'מרכז הרב' מתקיימת ברגעים אלו (חמישי). לאחר מצעד הדגלים המסורתי ועצרת התפילה בכותל, טקס עצרת התפילה בישיבת מרכז הרב מתקיים בנוכחות אישי ציבור רבים. העצרת המסורתית והחגיגית לרגל יום ירושלים בישיבת מרכז הרב מתקיימת במעמד ראש ממשלת ישראל- בנימין נתניהו ורעייתו, הרבנים הראשיים, ראש עיריית ירושלים- משה ליאון, שרים בכירים, חברי כנסת רבנים ואישי ציבור.

כבכל שנה מתקיימת העצרת החגיגית שמטרתה להודות על שחרור ירושלים ועל איחודה שהתרחש לפני 56 שנים. מאז שחרור ירושלים האירוע בישיבת מרכז הרב הוא מרכז החגיגות של יום ירושלים ומשתתפים רבים מגיעים אליו מכל קצות הארץ.