בעקבות עדכון ההנחיות של משרד הבריאות להתמודדות עם הידבקות בנגיף הקורונה, במסגרתם הוחלט על איסור לקיים אירועים של מעל 5,000 אנשים, דווח בכלי התקשורת כי מרתון ירושלים שתוכנן להיערך ב-20 במרץ עשוי להתבטל. מדוברות העירייה נמסר כי הנושא נבחן, כשלדבריהם "בהמשך להודעת מנכ"ל משרד הבריאות, עיריית ירושלים מודיעה כי היא בוחנת את הנחיות משרד הבריאות ביסודיות, ותפרסם את ההשלכות על קיום המרתון בהמשך".