יו"ר הבית היהודי, שר החינוך הרב רפי פרץ, החליט שלא להאריך את כהונתו של חבר הוועדה לתכנון ותקצוב, פרופ' יוסי שיין מאוניברסיטת תל אביב. על פי הדיווח באתר 'דה- מרקר', הרב פרץ מתכנן למנות לתפקיד את חבר הכנסת לשעבר, פרופ' אריה אלדד.

לדברי גורמים בוועדה, החלטתו של פרץ על סיום כהונתו של שיין הגיעה בניגוד להמלצתה של יו"ר הוועדה, פרופ' יפה זילברשץ, שביקשה להאריך את כהונתו. גורמים בוועדה אמרו כי כהונתו של שיין לא חודשה בגלל התנגדותו להקמת הפקולטה לרפואה באוניברסיטת אריאל, יוזמה שקידם שר החינוך לשעבר נפתלי בנט.

מלשכתו של הרב רפי פרץ נמסר בתגובה: "השר מודה לפרופ׳ יוסי שיין על תרומתו בוות"ת, וסמוך ובטוח שהוא ימשיך לתרום להשכלה הגבוהה בישראל בשדות נוספים".

ממל"ג נמסר: "בשנת 2016 פרופ' יוסי שיין מונה לחבר ות"ת לתקופה של 3 שנים והוא השלים את הקדנציה במלואה. אנו מודים לפרופ' שיין על תרומתו הרבה להשכלה הגבוהה בישראל".

מטעמו של שיין לא נמסרה תגובה.

באופוזיציה כבר החלו לגנות את החלטתו של הרב פרץ למנות את פרופ' אלדד במקום פרופ' שיין. חה"כ אורלי פרומן ממפלגת כחול לבן, אמרה כי "נדמה שהשר פרץ כבר החליט אם לא לקדם את מערכת החינוך אז לפחות לקדם מקורבים. שר החינוך מחליט לא להאריך קדנציה של חבר וועדה לתכנון ותקצוב בתקופת ממשלת מעבר. ההחלטה האומללה הזו מונעת בראש ובראשונה מתוך שיקולים אישיים ובכדי לקדם את האינטרסים שלו ושל מקורביו. כשאין תוכניות מסתפקים במשחק כיסאות אינסופי".