ראש הממשלה נתניהו נזף הערב (שבת) ברב רפי פרץ בעקבות דברי התמיכה שלו בטיפולי המרה לקהילה הלהט"בית.

הוא הגיב ואמר כי "דבריו של שר החינוך ביחס לקהילה הגאה אינם מקובלים עליי ואינם משקפים את עמדת הממשלה בראשותי". הוא שוחח עם הרב רפי, שהבהיר את דבריו.

בשיחה בין השניים הדגיש הרב כי "מערכת החינוך הישראלית תמשיך לקבל את כל ילדות וילדי ישראל באשר הם, ללא שום הבדל של נטייה מינית".

סערה פרצה עם פרסום הראיון של הרב פרץ בחדשות סוף השבוע, בו אמר כי  "אפשר לעשות את זה", בהתייחס לטיפולי המרה לקהילה הגאה. "אני מכבד כל אדם באשר הוא אדם. אני מודה שאני באופן אישי, אני רב בישראל, התורה שלנו אומרת לנו דברים אחרים. אבל זה לא אומר שאני מסתכל עכשיו ונותן להם ציונים".