לאחר שורה של סערות שנוצרו כתוצאה משירותם של חיילות וחיילים צעירים, שירות בתי הסוהר הודיע רשמית וסופית כי השלים את מהלך הסרת החיילים הסדירים, וקבע כי לא ישרתו בשורותיו בעתיד.

שירות בתי הסוהר הודיע כי השלים מהלך ארוך טווח, במסגרתו הועברו כלל החיילים הסדירים משורות הארגון, ונעצרה קליטת חיילים נוספים לשורותיו. שירותם של חיילי החובה החל בשנת 2005 עם תיקון לחוק שירות ביטחון. תיקון זה העניק לשר הביטחון, בהתייעצות עם השר לביטחון לאומי, את הסמכות להורות על הצבתם של חיילי חובה ביחידות הביטחוניות בשירות בתי הסוהר.

מאז 2005 שירתו אלפי חיילים בשורות הארגון בתפקידים שונים, ביניהם גם בתפקידים בעלי חיכוך גבוה עם אסירים פליליים וביטחוניים.

מהשר לביטחון לאומי איתמר בן גביר, המופקד על השב"ס נמסר:  "גאה בהחלטה שהובלתי לסיום שירותם של חיילי החובה בשירות בתי הסוהר, מהלך חשוב ששם קץ למצב בלתי הגיוני בין כותלי הכלא והביא לשינוי הראוי. שמח שהובלתי את המהלך להוצאת משרתות משירות מול אסירים ביטחוניים, מתוך מחויבות לשמור על כבודן וביטחונן. אני מברך על יישום המהלך ומודה לכל מי שלקח חלק בהשלמתו. נמשיך לפעול בנחישות למען ביטחון אזרחי ישראל ושמירה על ערכינו."